MeSH handledningen - Karolinska Institutet Universitetsbiblioteket

HANDLEDNING I MESHINDEXERING
GUN-BRIT KNUTSSÖN & KLAS MOBERG
UNIVERSITETSBIBLIOTEKET 2016
1
INNEHÅLLSFÖRTECKNING
HANDLEDNING I MESH-INDEXERING
3
1. MESH-VOKABULÄREN 4
1.1 HISTORIK .............................................................................................................................................................5
1.2 DESKRIPTORER (MESH-TERMER) ......................................................................................................................6
1.2.1 Alternativa termer (synonymer) och korsreferenser ....................................................................................... 6
1.2.2 Deskriptorer (MeSH-termer) och trädstrukturer............................................................................................. 8
1.2.3 Kategorier ................................................................................................................................................................... 8
1.2.4 Check tags ................................................................................................................................................................ 11
1.2.5 Geografiska termer ................................................................................................................................................ 12
1.2.6 Publikationstyper ..................................................................................................................................................... 12
1.2.7 Aspektord .................................................................................................................................................................. 13
1.2.8 Tilläggsbegrepp........................................................................................................................................................ 26
2. SÅ HÄR GÖR MAN – ALLMÄNNA INDEXERINGSPRINCIPER 27
2.1 VILKET MATERIAL INDEXERAS? ....................................................................................................................... 27
2.2 INDEX MEDICUS (IM), NON-INDEX MEDICUS (NIM) ................................................................................ 28
2.3 KOORDINERAD INDEXERING ......................................................................................................................... 28
2.4 FEM VANLIGA FEL VID INDEXERING ............................................................................................................... 29
2.4.1 För generell deskriptor........................................................................................................................................... 29
2.4.2 Felaktigt aspektord ................................................................................................................................................. 31
2.4.3 Deskriptorer från fel kategori ............................................................................................................................. 32
2.4.4 Ofullständig koordination...................................................................................................................................... 33
2.4.5 Missförstånd i samband med ordens semantik ............................................................................................. 35
2.5 INDEXERINGSÖVNING..................................................................................................................................... 36
3 LÄNKAR OM MESH-INDEXERING 38
4 MEDICINSK LATHUND 39
4.1 ALLMÄNT .......................................................................................................................................................... 39
4.2 ANATOMISK LÄGESBESKRIVNING................................................................................................................... 39
4.3 CYTOLOGI ........................................................................................................................................................ 40
4.4 KEMISKA ÄMNEN .............................................................................................................................................. 40
4.5 KIRURGISKA METODER.................................................................................................................................... 40
4.6 LÄKEMEDEL ....................................................................................................................................................... 41
4.7 PATOLOGISKA FÖRÄNDRINGAR .................................................................................................................... 41
4.8 SJUKDOMAR...................................................................................................................................................... 42
4.8.1 Tumörer, svulster, neoplasmer, cancer ............................................................................................................. 42
4.8.2 Syndrom – flera sammanhängande sjukdomstecken .................................................................................. 43
4.8.3 Trauma, skador, olycksfall.................................................................................................................................... 43
4.9 UNDERSÖKNINGAR......................................................................................................................................... 43
5. TERMER FÖR ”UPPLEVELSER” OCH ”BEMÖTANDE” 45
6. KONTAKTA OSS 46
2
HANDLEDNING I MESH-INDEXERING
MeSH, Medical Subjects Headings är en samling av kontrollerade termer som används
för indexering, sökning och katalogisering av biomedicinska tidskrifter och böcker.
MeSH produceras av National Library of Medicine (NLM) i USA.
MeSH är en dynamisk vokabulär som revideras och uppdateras årligen. Innehållet i
vokabulären är relaterat till användningen av medicinsk terminologi i litteraturen och nya
koncept inkluderas regelbundet.
Den första officiella listan med subject headings publicerades vid NLM i 1954; en lista över
subheadings var inkluderad.
1960 introducerades det datorstödda systemet Medical Literature Analysis and Retrieval
System (MEDLARS) och MeSH genomgick en komplett revidering. Den tryckta versionen av
MeSH publicerades sista gången i 2003 och sedan 2004 är MeSH tillgänglig endast
elektroniskt.
MeSH har översatts till flera språk, bl a till svenska (Svensk MeSH).
Verktyg – MeSH:
•
•
•
•
Svensk MeSH
NLM MeSH Browser
MeSH-Database/PubMed
SveMed+
3
1. MESH-VOKABULÄREN
MeSH, Medical Subject Headings, är en samling av kontrollerade termer som används för
indexering, sökning och katalogisering av biomedicinska tidskrifter och böcker. MeSH
produceras av National Library of Medicine (NLM) i USA.
Hela MeSH-terminologin finns sökbar på internet, både på NLMs webbplats och på
Karolinska Institutets Universitetsbiblioteks (KIB) webbplats. KIB:s databas, Svensk MeSH,
innehåller också svenska översättningar av nästan alla termer.
Termerna är organiserade både alfabetiskt och hierarkiskt. På den allra mest övergripande
nivån i den hierarkiska strukturen finns mycket breda termer som "Anatomy", "Mental
Disorders", "Enzymes", "Coenzymes" och "Enzyme Inhibitors". På mer specifika nivåer finns
termer som "Ankle", "Conduct Disorder" och "Calcineurin".
Det finns 27 149 ämnesord (i MeSH-vokabulären kallas de "Descriptors", "MeSH Headings"
eller "Main Headings"). Dessutom finns mer än 200 000 så kallade "Supplementary Concept
Records" över kemiska substanser och läkemedel. Det finns också tusentals korshänvisningar
som hjälper till att hitta den riktiga MeSH-termen. Om man slår upp "Vitamin C" får man
veta att den rätta MeSH-termen för det ämnet är "Ascorbic Acid".
Läs MeSH FactSheet på NLMs hemsida
4
1.1 HISTORIK
2009
Eahil MeSH SIG (Special Interest Group about MeSH translations) – KIB co-chair
2003
Sista årgången av tryckt MeSH.
2000
Databasen SveMed+ startar med engelska och svenska MeSH-termer.
1999
MeSH Browser i elektronisk version.
1998
Svensk MeSH på Internet.
1995
Översättning av MeSH-termerna börjar i Svensk MeSH.
1982
Databasen Swemed startar (endast engelska MeSH-termer).
1968
Sverige indexerar ett stort antal tidskrifter för Medline.
1966
Medline startar.
1960
Vokabulären får sitt namn Medical Subject Headings (MeSH).
1956
National Library of Medicine bildas i USA.
1879
Index Medicus påbörjas.
1865
Insamling av termer börjar på Army Medical Library i USA.
Läs mer om MeSH-historiken:
•
•
•
History of MeSH (NLM)
Publications about MeSH (NLM)
Läs också om NLM:s historia
5
1.2 DESKRIPTORER (MESH-TERMER)
Deskriptorer [eng. descriptors] är den övergripande termen för ämnesorden [eng. subject
headings] i MeSH. De kallas också för "MeSH descriptors", "MeSH headings" och "main
headings". På svenska talar man ofta om MeSH-termer.
En deskriptor/MeSH heading/main heading/MeSH-term är den föredragna, kontrollerade
termen för att beskriva en viss företeelse eller ett visst fenomen.
De vanligaste deskriptorerna är begränsade till ett visst område inom medicin, biomedicin,
farmakologi eller liknande ämne. De består av enstaka ord eller fraser, men de kallas numera
också för begrepp [eng. concepts].
Ex. Heart, Psychosurgery, Nurse Clinicians, Thorax.
Det finns tre andra typer av deskriptorer eller MeSH-termer som skiljer sig lite ifrån de
vanliga ämnesorden ovan. Det handlar om "geografiska termer", "check tags" och
"publikationstyper". De tillhandahåller ytterligare sätt att klassificera material på.
1.2.1 ALTERNATIVA TERMER (SYNONYMER) OCH
KORSREFERENSER
Alternativa termer [eng. "Entry Terms"] är synonymer, stavningsvarianter och förkortningar.
De används både vid indexering och sökning. I PubMed och SveMed+ kan man söka på de
alternativa termerna som i sin tur mappas till den kontrollerade MeSH-termen. Där måste
man först hitta deskriptorn, dvs den kontrollerade termen i NLM MeSH Browser eller i
Svensk MeSH.
•
•
Kontrollerade termen "Malocclusion" i NLM MeSH Browser
Kontrollerade termen "Malocclusion" i Svensk MeSH
"Korsreferenser" är besläktade (relaterade) termer, men inte nödvändigtvis ur samma
ämnesområde. Genom dessa korsreferenser får användaren förslag om ytterligare termer
tillgängliga i vokabulären. De besläktade termerna hittar man vid rubriken "See also".
MeSH Heading
Malocclusion
6
Tree Number C07.793.494
Annotation
entry term ANGLE'S CLASSIFICATION: Angle's classes MALOCCLUSION, ANGLE CLASS
I & MALOCCLUSION, ANGLE CLASS II & MALOCCLUSION, ANGLE CLASS III are also
available but index Angle's classification in general or unspecified as MALOCCLUSION /
class
Scope Note
Such malposition and contact of the maxillary and mandibular teeth as to interfere with the
highest efficiency during the excursive movements of the jaw that are essential for
mastication. (Jablonski, Illustrated Dictionary of Dentistry, 1982)
Entry Term
•
Angle's Classification
•
Cross Bite
•
Crossbite
•
Tooth Crowding
See Also
•
Dentition
•
Mandibular Advancement
•
Orthodontics, Corrective
•
Prognathism Retrognathism
Allowable Qualifiers
BL CF CI CL CN CO DH DI DT EC EH EM EN EP ET GE HI IM ME MI MO NU PA PC PP
PS PX RA RH RI RT SU TH UR US VE VI
Unique ID
D008310
Övningsuppgift
•
Jfr posterna för Malocclusion i NLM MeSH Browser resp. Svensk MeSH. [Se särskilt
fälten för Entry terms och See also resp. Alternate Forms.]
•
Posten för termen "Malocclusion" i NLM MeSH Browser
•
Posten för termen "Malocclusion" i Svensk MeSH
7
1.2.2 DESKRIPTORER (MESH-TERMER) OCH TRÄDSTRUKTURER
Alla deskriptorer är indelade i 16 olika ämnesgrupper eller kategorier. Dessa kategorier, med
sina subkategorier, är hierarkiskt inordnade i så kallade trädstrukturer (tree structures) som
används både vid indexering och sökning.
Indexeraren/katalogisatören använder trädstrukturer för att finna de mest specifika termer
som är tillgängliga i MeSH-vokabulären för att täcka de olika aspekterna i texterna. Vid
sökning i PubMed får man automatiskt referenser till alla smalare termer som är grupperade
under en mer generell term i en trädstruktur. Det kallas i PubMed MeSH Browser för
"explode". Vill man inte ha referenser kopplade till underordnade termer måste man aktivt
välja bort detta. Det gäller även aspektorden och deras hierarkier.
Trädstruktur för "Lipids" ur MeSH Browser (NLM)
Exempel:
•
Lipids [D10]
Trädstruktur för "Lipids" ur Svensk MeSH (KIB)
Exempel:
•
Lipids [D10]
Övningsuppgift
Jämför posterna för Lipids i NLM MeSH Browser resp. Svensk MeSH. Ett plustecken [+] efter
en term indikerar att termen har ytterligare underordnade termer.
•
Post för "Lipids" från MeSH Browser
•
Post för "Lipids" från Svensk MeSH
1.2.3 KATEGORIER
MeSH består av nedanstående kategorier. Till kategori A, B, C, D och E finns kommentarer
med avseende på indexering. Klicka på respektive länk så dyker kommentarerna upp på en ny
sida.
Om du vill navigera i respektive trädstruktur, besök Svensk MeSH eller NLMs webbläsare. Se
länkar nedan.
8
•
Kategorierna via Svensk MESH
•
Kategorierna via NLM MeSH Browser
A – Anatomi
Anatomiska termer som hänvisar både till människor och djur.
A13 täcker enbart djurens anatomi.
B – Organismer
C – Sjukdomar
Sjukdomar, både experimentella och kliniska.
C22 täcker enbart in djursjukdomar.
Exempel på hur termer avseende sjukdomar kan konstrueras.
prekoordinerade termer – organ/sjukdom
Brain Diseases
Skin Diseases
prekoordinerade termer – organism/sjukdom
Salmonella Infections
Trypanosomiasis
organ + prekoordinerade termer – organ/sjukdom
Toes + Foot diseases
Vitreous body + Eye Diseases
syndrom
deskriptiva
Fatigue Syndrome, Chronic
eponyma
Korsakoff Syndrome
infektioner
prekoordinerade överordnade termer
Virus Diseases; Bacterial Infections
prekoordinerade underordnade termer
Bordetella Infections; HIV Infections
cancersjukdomar
Tumör, cancer och karcinom är synonymer. Man skiljer inte mellan benign
(godartad) och malign (elakartad) tumörpatologi.
Indexeringspolicy gällande tumörer!
9
Indexera varje tumör på minst två sätt:
1. med term som betecknar den histologiska typen, t.ex. "Carcinoma,
basal cell"
2. med term som visar vilket organ som är angripet, t.ex. "Skin neoplasms"
•
Artikel med kombinationen "Carcinoma, basal cell" och "Skin neoplasms" ur PubMed
D – Kemikalier och läkemedel
Kemiska termer inklusive uppgifter om synonymer, farmakologiska effekter och även
vissa produktnamn finns tillgängliga via NLM:s MeSH Browser. De kallas
"Supplementary Concept Records" eller bara "Supplementary Concepts" och är idag över
200 000 till antalet.
För att begränsa sökningen till att gälla enbart kemiska termer i NLM:s MeSH Browser,
kryssa för "Supplementary Concepts".
Övningsuppgift
Sök efter produktnamnet "Viagra" i NLM:s MeSH Browser och begränsa till
"Supplementary Concepts". Vad får du för svar?
E – Tekniker och utrustning för analys, diagnostik och terapi
Tekniker och metoder skall bara indexeras om de är huvudaspekter eller om de
diskuteras mera utförligt.
Exempel: "EEG in epilepsy"
Epilepsy
Electroencephalography
•
Artikel med ovanstående kombination hämtad ur PubMed.
F – Psykiatri och psykologi
G – Fenomen och processer
H – Specialiteter och yrken
I – Antropologi, utbildning, sociologi och sociala företeelser
J – Teknologi, industri, lantbruk
10
K – Humaniora
L – Informatik
M – Personer
N – Hälso- och sjukvård
V – Publikationers särdrag
Z – Geografiska orter
1.2.4 CHECK TAGS
Check tags (ej översatt från eng. "check tags") är en speciell typ av deskriptorer.
Vid indexering måste varje dokument rutinmässigt granskas med avseende på dessa. Namnet
"check tags" kommer just från att man måste "checka av" eller pricka av dessa varje gång man
indexerar. Detta gör check tags mycket användbara vid sökning, t.ex. för att avgränsa
sökningen.
Följande check tags finns:
•
Pregnancy
•
Infant, Newborn (to 1 month)
•
Infant (1-23 months)
•
Child, Preschool (2-5)
•
Child (6-12)
•
Adolescent (13-18)
•
Young Adult (19-24)
•
Adult (19-44)
•
Middle Aged (45-64)
•
Aged (65-79)
•
Aged, 80 and over
•
•
•
•
Animals
Cats
Cattle
Chick Embryo
11
•
•
•
•
•
•
Dogs
Guinea Pigs
Cricetinae
Mice
Rabbits
Rats
•
•
•
•
•
•
•
•
•
History, Ancient
History, Medieval
History, 15th Cent
History, 16th Cent
History, 17th Cent
History, 18th Cent
History, 19th Cent
History, 20th Cent
History, 21st Cent
•
•
•
Humans
Male
Female
1.2.5 GEOGRAFISKA TERMER
Geografiska termer [eng. "Geographics"] är också de deskriptorer. De omfattar kontinenter,
regioner, länder, stater och andra geografiska undergrupper. De listas som en grupp i kategori
Z i MeSH trädstruktur, dvs den hierarkiska klassifikationen av deskriptorer.
Exempel ur kategori Z
•
Sweden
•
London
•
Asia
•
Comoros
1.2.6 PUBLIKATIONSTYPER
Publikationstyper [eng. "publication types"] är deskriptorer som skiljer sig lite ifrån vanliga
deskriptorer eller MeSH-termer. De beskriver vad en publikationstyp är snarare än vad den
innehåller i ämnesväg.
I stället för att utgöra en representation av artikelns eller bokens ämnesinnhåll, karaktäriserar
de informationens natur eller på vilket sätt den förmedlas, t.ex. brev, historisk artikel,
återkallad publikation eller en klinisk konferens.
Vissa publikationstyper är också vanliga deskriptorer och för att skilja på dessa används
numera "...as topic" när det handlar om innehållet. Så använder man t.ex. Portraits för att
förmedla att dokumentet är ett portätt till formen, och Portraits as topic för att visa att
dokumentet handlar om porträtt.
Exempel
•
Annual Reports
•
Review
•
Nurses' Instruction
•
Posters
12
•
Case Reports
Alla publikationstyper finns i NLM MeSH Browser och Svensk MeSH. NLM har också
publicerat en lista över alla publikationstyper.
NLM:s lista över alla publikationstyper
1.2.7 ASPEKTORD
Aspektord [eng. "subheadings" eller "qualifiers"] används för att täcka olika aspekter av en
deskriptor ("main heading" eller "MeSH heading"). Det finns för närvarande 82 aspektord i
MeSH. Vissa av dem är, precis som deskriptorerna, indelade i egna trädstrukturer med mer
övergripande aspekter och underliggande termer.
Vid indexering är aspektorden direkt kopplade till en deskriptor, dvs de visar från vilken
aspekt respektive deskriptor är behandlad i en artikel.
Exempel: Terapi vid hepatit
•
Titta på "THERAPY" i NLM MeSH Browser
•
Titta på "HEPATITIS" i NLM MeSH Browser
Det finns särskilda regler och begränsningar i samband med användningen av aspektord. Det
är därför nödvändigt att läsa kommentarerna (annoteringarna) till respektive aspektord i
NLM MeSH Browser.
Tänk på att
En viktig regel att lägga på minnet när man använder aspektord är att vara så specifik som
möjligt i sitt val. Finns ett specifikt aspektord tar man det istället för det mer generella. Alltså
samma regel som gäller deskriptorer [eng. "main headings"].
13
1.2.7.1 ALFABETISK LISTA ÖVER ASPEKTORD
•
Se även NLMs alfabetiska lista med aspektord
AA
Analogs & derivatives
1975
AB
Abnormalities
1966
AD
Administration & dosage
1966
AE
Adverse effects
1966
AG
Agonists
1995
AH
Anatomy & histology
1966
AI
Antagonists & inhibitors
1968
AN
Analysis
1967
BI
Biosynthesis
1966
BL
Blood
1967
BS
Blood supply
1966
CF
Cerebrospinal fluid
1967
CH
Chemistry
1991
CI
Chemically induced
1967
CL
Classification
1966
CN
Congenital
1966
CO
Complications
1966
CS
Chemical synthesis
1968
CT
Contraindications
1991
CY
Cytology
DE
Drug effects
1966
DF
Deficiency
1975
14
DH
Diet therapy
1975
DI
Diagnosis
1966
DT
Drug therapy
1966
EC
Economics
1978
ED
Education
1967
EH
Ethnology
1975
EM
Embryology
1966
EN
Enzymology
1966
EP
Epidemiology
1989
ES
Ethics
2003
ET
Etiology
1966
GD
Growth & development
1966
GE
Genetics
1978
HI
History
1966
IM
Immunology
1966
IN
Injuries
1966
IP
Isolation & purification
1966
IR
Innervation
1966
IS
Instrumentation
1966
LG
Legislation & jurisprudence
1966
MA
Manpower
1968
ME
Metabolism
1966
MI
Microbiology
1967
15
MO
Mortality
1967
MT
Methods
1975
NU
Nursing
1966
OG
Organisation & administration
1978
PA
Pathology
1966
PC
Prevention & control
1966
PD
Pharmacology
1988
PH
Physiology
1966
PK
Pharmacokinetics
1988
PO
Poisoning
1966
PP
Physiopathology
1966
PS
Parasitology
1975
PX
Psychology
1978
PY
Pathogenicity
1966
RA
Radiography
1967
RE
Radiation effects
1966
RH
Rehabilitation
1967
RI
Radionuclide imaging
1978
RT
Radiotherapy
1966
SC
Secondary
1980
SD
Supply & distribution
1968
SE
Secretion
1968
SN
Statistics & numerical data
1989
16
ST
Standards
1968
SU
Surgery
1966
TD
Trends
1978
TH
Therapy
1966
TM
Transmission
1975
TO
Toxicity
1966
TR
Transplantation
1966
TU
Therapeutic use
1966
UL
Ultrastructure
1975
UR
Urine
1967
US
Ultrasonography
1991
UT
Utilization
1968
VE
Veterinary
1966
VI
Virology
1995
1.2.7.2 ASPEKTORD OCH LÄKEMEDEL
När man använder aspektord (eng."subheadings" eller "qualifier") vid indexering av läkemedel
är det viktigt att man väljer det aspektord som är mest specifikt. Välj aldrig ett övergripande
aspektord om det finns ett mer specifikat som passar in.
Titta på hierarkien under "pharmacology" och jämför exemplen från PubMed nedan.
•
Qualifier Hierarchies
Generellt
•
Pharmacology (PD) – exempel i PubMed
Specificerat
17
•
Therapeutic use (TU) – exempel i PubMed
•
Administration & dosage (AD) – exempel i PubMed
•
Adverse effects (AE) – exempel i PubMed
•
Poisoning (PO) – exempel i PubMed
•
Toxicity (TO) – exempel i PubMed
1.2.7.3 ASPEKTORD OCH TRÄDSTRUKTURER
Vissa av aspektorden är, precis som deskriptorerna, indelade i en hierarkisk struktur, en
trädstruktur. Dessa trädstrukturer är ämnade att hjälpa indexeraren att hitta mer specifika
respektive mer generella aspektord.
•
Se NLM:s hierarkiska lista med aspektord
När man söker i PubMed får man, precis som i fallet med deskriptorerna, automatiskt med
referenser kopplade till alla underordnade aspektord. Vill man inte det måste man aktivt välja
bort den funktionen.
1.2.7.4 DUBBLETTER: HUVUDORD OCH ASPEKTORD
Vissa termer i MeSH förekommer både som main headings och aspektord (subheadings). I
artiklar där ett ämne, ett begrepp eller en disciplin beskrivs i mer allmänna ordalag används
main headings; speciella aspekter täcks med aspektord (subheadings).
Övningsuppgift
Jämför nedanstående exempel! Samma term förekommer som både deskriptor och aspektord,
men med olika innebörd. Klicka på länkarna för att se exempel ur PubMed.
Sök på "surgery" i NLM MeSH Browser. Jämför de båda alternativen.
•
NLM MeSH Browser
Surgery
Deskriptor (allmänt, discipliner) Aspektord/Qualifier (aspekter)
"Kirurgi på medeltiden"
"Kirurgi vid magsår"
18
General Surgery / HISTORY
Stomach Ulcer / SURGERY
•
General Surgery / HISTORY – exempel i PubMed
•
Stomach Ulcer / SURGERY – exempel i PubMed
Pathology
Deskriptor (allmänt, discipliner) Aspektord/Qualifier (aspekter)
"Utbildning inom patologin"
"Hjärnans patologi"
Pathology / EDUCATION
Brain / PATHOLOGY
•
Pathology / EDUCATION – exempel i PubMed
•
Brain / PATHOLOGY – exempel i PubMed
Rehabilitation
Deskriptor (allmänt, discipliner) Aspektord/Qualifier (aspekter)
"Rehabilitering i framtiden"
"Rehabilitering av handikappade"
Rehabilitation / TRENDS
Disabled Persons/ REHABILITATION
•
Rehabilitation / TRENDS – exempel i PubMed
•
Disabled Persons/ REHABILITATION – exempel i PubMed
1.2.7.5 HUR VÄLJER MAN ASPEKTORD?
Innan man väljer aspektord måste man förstås först ha valt deskriptorer. Nästa steg är att
behandla varje deskriptor för sig och se om de behöver modifieras på något sätt. Frågan man
bör ställa sig är från vilken aspekt eller från vilken synvinkel en viss företeelese (deskriptorn)
behandlas.
Exempel: Om en artikel handlar om leverns metabolism hos en patient med artrit och
samtidigt tar upp effekterna av aspirinbehandling på den metaboliska funktionen, måste
indexeraren fundera över följande (aspektorden anges med versaler):
Fråga 1:
Från vilka aspekter behandlas levern?
19
Svar:
metabolism, läkemedelseffekter
Indexera så här:
Liver / METABOLISM / DRUG EFFECTS
Fråga 2:
Från vilka aspekter behandlas artrit?
Svar:
metabolism, läkemedelsterapi
Indexera så här:
Arthritis / METABOLISM / DRUG THERAPY
Fråga 3:
Från vilka aspekter behandlas aspirin?
Svar:
farmakologisk effekt, terapeutisk effekt
Indexera så här:
Aspirin / PHARMACOLOGY / THERAPEUTIC USE
1.2.7.6 VANLIGA FEL
Det finns några fel som är vanligare än andra när det handlar om att välja aspektord.
Felaktiga kombinationer av deskriptor och aspektord
Felaktiga kombinationer av deskriptor och aspektord är en typ av fel som bottnar i att vissa
aspektord inte får användas tillsammans med vissa deskriptorer. Vilka det gäller finns angivet
i NLM MeSH Browser.
Exempel: "Analys av fostervatten"
RÄTT
FEL
Amniotic Fluid / CHEMISTRY
Amniotic fluid / ANALYSIS
20
Aspektordet ANALYSIS får inte användas i kombination med termer från kategori A
(Anatomi). Informationen finns i kommentaren (scope notes) i NLM MeSH Browser.
Exempel: "Medfödda öronanomalier"
RÄTT
FEL
Ear / ABNORMALITIES
Ear / CONGENITAL
Aspektordet CONGENITAL får inte användas i kombination med termer från kategori A
(Anatomi).
Exempel: "Komplikationer efter in vitro-fertilisering"
RÄTT
FEL
Fertilization in vitro / ADVERSE
EFFECTS
Fertilization in vitro /
COMPLICATIONS
Aspektordet COMPLICATIONS får inte användas i kombination med termer från kategori E
(tekniker, metoder).
För brett aspektord
Ett annat fel är att man väljer ett för generellt aspektord. Vissa av aspektorden har egna
trädstrukturer med övergripande och underliggande termer. Det framgår också av NLM
MeSH Browser vilka aspektord som är berörda. Kommentaren hänvisar till och informerar
om mer specifika aspektord.
•
NLM MeSH Browser
•
Aspektordens egna trädstrukturer
Exempel: "Ultraljudsdiagnostik av levercancer"
RÄTT
FEL
Liver Neoplasms / ULTRASONOGRAPHY
Liver Neoplasms / DIAGNOSIS
Exempel: "Apomorfin i terapi av Parkinsons sjukdom"
21
RÄTT
FEL
Parkinson Disease / DRUG THERAPY
Parkinson Disease / THERAPY
Angivna instruktioner i kommentarerna [eng. Scope Notes] följs inte upp
Många aspektord har särskilda instruktioner om hur de får användas, men det är inte helt
ovanligt att man missar dessa. Man bör vara noggrann med att läsa kommentarerna [eng.
Scope Notes] i NLM MeSH Browser innan man väljer aspektord.
22
Exempel: "Träspritintoxikation bland alkoholmissbrukare"
RÄTT
FEL
Methanol / POISONING
Methanol / TOXICITY
1.2.7.7 VANLIGA KOMBINATIONER
Vissa kombinationer av deskriptor och aspektord är vanligare än andra. Nedan finns några
kombinationer som ofta används tillsammans. Deskriptorn anges som typ (t.ex. sjukdom eller
organ) medan aspektordet anges i sin fullständiga form.
Sök efter egna exempel på kombinationerna nedan med hjälp av MeSH database. Välj
"Restrict Search to Major Topic readings only" och "Do Not.ex.plode this term".
•
MeSH database
Disease A / COMPLICATIONS, Disease B / ETIOLOGY
När man vet att sjukdom A orsakar sjukdom B.
Disease A / COMPLICATIONS, Disease B / COMPLICATIONS
När sjukdomar förekommer samtidigt, orsaksförhållandet är inte känt.
Disease / CHEMICALLY INDUCED, Drug / ADVERSE EFFECTS
Sjukdomens orsak är läkemedelsbiverkning
Disease / DIAGNOSIS, Drug / DIAGNOSTIC USE
Sjukdomens diagnos ställs med hjälp av kemisk substans
Disease / PATHOLOGY, Organ / PATHOLOGY
Vävnadsprov, histologiska och patologiska undersökningar
Radioisotope / DIAGNOSTIC USE, Disease / RADIONUCLIDE, Organ /
RADIONUCLIDE
Undersökningar med hjälp av radioaktiva spårämnen
Organ / DRUG EFFECTS, Drug / PHARMACOLOGY
Effekt av ett läkemedel eller en kemisk substans på ett organ
Organism / DRUG EFFECTS, Drug / PHARMACOLOGY
Effekt av ett läkemedel eller en kemisk substans på en mikroorganism
23
Organ / METABOLISM, Drug / METABOLISM eller / PHARMACOKINETICS
Metabolism eller farmakokinetik av ett läkemedel eller en kemisk substans i ett organ
Organ / CHEMISTRY, Drug / ANALYSIS
Kemisk analys av en substans i ett organ
Radioisotope / THERAPEUTIC USE, Disease / RADIOTHERAPY
Terapeutisk användning av radioaktiva ämnen
Organ / SURGERY, Disease / SURGERY
Kirurgisk behandling, operationer
Disease / MICROBIOLOGY, Organ / MICROBIOLOGY, Organism / ISOLATION &
PURIFICATION
Mikrobiologiska undersökningar
Disease / ETIOLOGY, Technique / ADVERSE EFFECTS
Sjukdomens orsak är behandlingsbiverkningar
Disease / ULTRASONOGRAPHY, Organ / ULTRASONOGRAPHY
Ultraljudsundersökningar
Disease / RADIOGRAPHY, Organ / RADIOGRAPHY
Röntgenundersökningar
Disease / PHYSIOPATHOLOGY, Organ / PHYSIOPATHOLOGY
Organens dysfunktion under ett sjukdomstillstånd
Physiologic process / DRUG EFFECTS, Drug / PHARMACOLOGY
Ett läkemedel eller en kemisk substans påverkar fysiologin
Psychologic process / DRUG EFFECTS, Drug / PHARMACOLOGY
Ett läkemedel eller en kemisk substans påverkar psykologin
Organism / METABOLISM, Drug / METABOLISM
Metabolism av ett läkemedel eller en kemisk substans i mikroorganismer
Organ / METABOLISM, Disease / METABOLISM
Organmetabolism under ett sjukdomstillstånd
Disease / DRUG THERAPY, Drug / THERAPEUTIC USE
Läkemedelsterapi av en sjukdom
24
Organ / TRANSPLANTATION, Disease / SURGERY
Organtransplantationsterapi
Disease / IMMUNOLOGY, Organ / IMMUNOLOGY, Antibodies / ANALYSIS
Antikroppstitrar
25
1.2.8 TILLÄGGSBEGREPP
Utöver MeSH-termer finns så kallade tilläggsbegrepp [eng. Supplementary Concept Records]
som består av över 200 000 namn på kemiska ämnen kompletterade med bl a generiska namn,
synonymer, information om farmakologiska effekter, sällsynta sjukdomstillstånd och
indexeringsinformation. Här finns också information om "Chemical Abstracts Registry
Numbers".
•
Chemical Abstracts Registry Numbers
Tilläggsbegrepp används vid indexering och sökning av specifika kemiska begrepp när MeSHvokabulären inte räcker till.
Tilläggsbegreppen fanns tidigare i en tryckt version kallad Supplementary Concept Records.
Nu kan man hitta dem i NLM MeSH Browser.
Övningsuppgift
Vad är substansnamnet för läkemedlet "Viagra"? Och när inkluderades det som
tilläggsbegrepp?
26
2. SÅ HÄR GÖR MAN – ALLMÄNNA
INDEXERINGSPRINCIPER
1. Läs titeln
2. Läs författarens egen formulering av syften
3. Notera kapitelindelning, paragraf, tabeller, diagram mm
4. Läs slutsatser
5. Titta igenom bibliografiska referenser
6. Titta igenom abstract, sammanfattning
7. Titta igenom författarens egna ämnesord
8. Avgör vad som är huvudaspekter respektive biaspekter i artikeln
Tänk på att
1. Dra inte några egna slutsatser angående innehållet i artikeln!
2. Gör inte några egna utvärderingar! Ställ inte några egna diagnoser!
2.1 VILKET MATERIAL INDEXERAS?
Ett visst urval görs när man väljer vilka artiklar som ska indexeras för Medline/PubMed.
Urvalet nedan gäller förstås inte för alla databaser, andra regler kan användas beroende på
vilken databas man indexerar för. För SveMed+ gäller samma som för Medline/PubMed.
Indexeras
•
originalartiklar
•
biografier
•
fallbeskrivningar
•
relevant material från kongresser
•
relevanta ledare (editorials)
•
relevanta brev
•
relevanta nyheter
•
relevanta intervjuer
Indexeras ej
•
bokrecensioner
27
•
artiklar "klippta" ur andra tidskrifter
•
abstracts, sammanfattningar
•
annonser
2.2 INDEX MEDICUS (IM), NON-INDEX MEDICUS (NIM)
Alla termer som artiklarna indexerats med finns i Medline/PubMed. Söker man i de tryckta
katalogerna, dvs Index Medicus, förekommer endast artiklarnas huvudaspekter. De termer
som betraktas som huvudaspekter kallas därför "Index Medicus" eller "IM" och termer som är
biaspekter för "Non-Index Medicus" eller "NIM". Huvudaspekterna markeras vid indexering
med en asterisk (*).
•
se asterisk (*) – exempel i PubMed
IM (Index Medicus) "* Liver"
NIM (Non-Index Medicus) "Liver"
Organ, sjukdomar, behandlingsmetoder, läkemedel, kemiska substanser och fysiologiska
processer är ofta huvudaspekter (IM).
Experimentella djur, åldersgrupper och rutinundersökningar är oftast biaspekter (NIM).
För att söka efter artiklar med en viss huvudaspekt väljer man i MeSH Database "Restrict to
MeSH Major Topic". Huvudaspekt, Index Medicus-termer, "Major Topic" och asterisk
betyder alltså samma sak här.
•
Sök efter artiklar med "Safflower Oil" som huvudaspekt i "MeSH Database"
•
MeSH Database
2.3 KOORDINERAD INDEXERING
Medline/PubMed använder ett system av sk koordinerad indexering. Detta innebär att de
olika aspekterna i artiklarna beskrivs genom kombination (koordination) av deskriptorer och
aspektord. Man kan koordinera termerna på olika sätt.
Två eller flera "deskriptorer" (MeSH heading/main heading)
28
Exempel: "Prognos vid hjärtinfarkt" =
Myocardial Infarction + Prognosis
•
Exempel på artikel ur PubMed. [Se särskilt MeSH-termerna.]
•
Sök i PubMed: Myocardial infarction AND Prognosis
Deskriptor/ASPEKTORD
Exempel: "Dödlighet i hjärtinfarkt" =
Myocardial Infarction/MORTALITY
•
Exempel på artikel ur PubMed. [Se särskilt MeSH-termerna.]
•
Sök i PubMed: Myocardial Infarction/MORTALITY
Deskriptor följd av en eller flera "check tags"
Exempel: "Hjärtinfarkt hos män" =
Myocardial Infarction +
Male [check tag]
+ Humans [check tag]
•
Exempel på artikel ur PubMed. [Se särskilt MeSH-termerna.]
•
Sök i PubMed: Myocardial Infarction + Male + Humans
2.4 FEM VANLIGA FEL VID INDEXERING
2.4.1 FÖR GENERELL DESKRIPTOR
Ett problem kan vara att man valt en för generell deskriptor. Vissa mer allmänna deskriptorer
används enbart i de fall artikeln behandlar ett mycket brett område och i mycket generella
termer.
Läs nedanstående titel och abstract eller titta på hela referensen i PubMed. Titta också igenom
kommentarerna nedan.
•
Länk till hela referensen
TI –
29
Antibiotics as part of the management of severe acute malnutrition.
AB –
BACKGROUND:
Severe acute malnutrition contributes to 1 million deaths among children annually. Adding
routine antibiotic agents to nutritional therapy may increase recovery rates and decrease
mortality among children with severe acute malnutrition treated in the community.
METHODS:
In this randomized, double-blind, placebo-controlled trial, we randomly assigned Malawian
children, 6 to 59 months of age, with severe acute malnutrition to receive amoxicillin, cefdinir,
or placebo for 7 days in addition to ready-to-use therapeutic food for the outpatient treatment
of uncomplicated severe acute malnutrition. The primary outcomes were the rate of
nutritional recovery and the mortality rate.
RESULTS:
A total of 2767 children with severe acute malnutrition were enrolled. In the amoxicillin,
cefdinir, and placebo groups, 88.7%, 90.9%, and 85.1% of the children recovered, respectively
(relative risk of treatment failure with placebo vs. amoxicillin, 1.32; 95% confidence interval
[CI], 1.04 to 1.68; relative risk with placebo vs. cefdinir, 1.64; 95% CI, 1.27 to 2.11). The
mortality rates for the three groups were 4.8%, 4.1%, and 7.4%, respectively (relative risk of
death with placebo vs. amoxicillin, 1.55; 95% CI, 1.07 to 2.24; relative risk with placebo vs.
cefdinir, 1.80; 95% CI, 1.22 to 2.64). Among children who recovered, the rate of weight gain
was increased among those who received antibiotics. No interaction between type of severe
acute malnutrition and intervention group was observed for either the rate of nutritional
recovery or the mortality rate.
CONCLUSIONS:
The addition of antibiotics to therapeutic regimens for uncomplicated severe acute
malnutrition was associated with a significant improvement in recovery and mortality rates.
FEL
•
Anti-Bacterial Agents
Om mer specifika typer av antibiotika diskuteras ingående i artikeln ska dessa väljas. Det är
dock viktigt att även Anti-Bacterial Agents står kvar då man i största möjliga mån även ska
indexera den farmakologiska verkningsmekanism som ett läkemedel har. I MeSH browser
framgår det att Amoxicillin och Cephalosporins har Anti-Bacterial Agents som
Pharmacological Action. Antibiotikapreparatet cefdinir har ingen egen MeSH-term utan
30
existerar istället som ett så kallat Supplementary Concept Record. När man slår upp termen i
MeSH browser kan man läsa att termen indexeras med (Heading Mapped to) Cephalosporins.
RÄTT
•
•
•
Amoxicillin
Cephalosporins (cefdinir)
Anti-Bacterial Agents
2.4.2 FELAKTIGT ASPEKTORD
Läs nedanstående titel och abstract eller titta på hela referensen i PubMed. Titta också igenom
kommentarerna nedan.
•
Länk till hela referensen
TI –
Retinal toxicity of high dose intravitreal ganciclovir.
AB –
BACKGROUND: Intravitreal administration of ganciclovir has been used to treat
cytomegalovirus (CMV) retinitis in patients with acquired immune deficiency syndrome
(AIDS) who are unable to tolerate systemic antiviral therapy. Although retinal toxicity from
intravitreal ganciclovir has been observed in animal experiments, to our knowledge, retinal
toxicity from intravitreal ganciclovir has not been reported in humans. METHODS: A case of
inadvertent intravitreous injection of a high dose of ganciclovir (40 mg/0.1 ml) for CMV
retinitis in a patient with AIDS is presented. RESULTS: Despite immediate intervention with
vitreous surgery, permanent retinal damage and visual loss developed. Clinical observations
and photographic documentation are provided. CONCLUSION: Retinal toxicity can occur
from a high-dose intravitreal ganciclovir injection. This toxicity may result from the high
alkaline nature of this preparation, from osmotic damage, or from a direct effect of the
concentrated ganciclovir.
FEL
Ganciclovir / TOXICITY
•
Aspektordet TOXICITY
31
Enligt definitionen (scope note) får aspektordet TOXICITY användas endast i samband med
"experimentella" studier och undersökningar eller i samband med exponering till miljögifter.
RÄTT
Ganciclovir / ADVERSE EFFECTS
•
Aspektordet ADVERSE EFFECTS
Toxiska effekter av läkemedel och substanser i "kliniska" studier täcks av aspektordet
ADVERSE EFFECTS.
2.4.3 DESKRIPTORER FRÅN FEL KATEGORI
Läs nedanstående titel och abstract eller titta på hela referensen i PubMed. Titta också igenom
kommentarerna nedan.
•
Länk till hela referensen
Mandatory menu labeling in one fast-food chain in King County, Washington
Finkelstein EA, Strombotne KL, Chan NL, Krieger J.
Department of Health Services and Systems Research, Duke-National University of Singapore
Graduate Medical School, Singapore. eric.finkelstein@duke-nus.edu.sg
Abstract
BACKGROUND:
As part of a comprehensive effort to stem the rise in obesity, King County, Washington,
enforced a mandatory menu-labeling regulation requiring all restaurant chains with 15 or
more locations to disclose calorie information at the point of purchase beginning in January
2009.
PURPOSE:
The purpose of this study is to quantify the impact of the King County regulation on
transactions and purchasing behavior at one Mexican fast-food chain with locations within
and adjacent to King County.
32
METHODS:
To examine the effect of the King County regulation, a difference-in-difference approach was
used to compare total transactions and average calories per transaction between seven King
County restaurants and seven control locations focusing on two time periods: one period
immediately following the law until the posting of drive-through menu boards (January 2009
to July 2009) and a second period following the drive-through postings (August 2009 through
January 2010). Analyses were conducted in 2010.
RESULTS:
No impact of the regulation on purchasing behavior was found. Trends in transactions and
calories per transaction did not vary between control and intervention locations after the law
was enacted.
CONCLUSIONS:
In this setting, mandatory menu labeling did not promote healthier food-purchasing behavior.
FEL
•
Food Chain
Deskriptorn Food Chain hör till kategori G16 (Biologiska fenomen), därför kan den inte
användas i artikeln om snabbmatskedjor.
RÄTT
•
Fast Foods
2.4.4 OFULLSTÄNDIG KOORDINATION
Läs nedanstående titel och abstract eller titta på hela referensen i PubMed. Titta också igenom
kommentarerna nedan.
•
Länk till hela referensen
TI –
Long-wave ultraviolet radiation (UVA) and skin cancer
33
AB –
Ultraviolet light is frequently used for cosmetic tanning of the skin. UV light is known to be
carcinogenic, but this is attributed predominantly to short-wavelength UV radiation (UVB).
However, new data indicate a carcinogenic role for long avelength ultraviolet light (UVA)
also. In vitro studies have demonstrated DNA-damaging effects of UVA. In animals
"squamous cell carcinomas" and "melanomas" were induced by UVA alone or in combination
with UVB. Reference to a possible carcinogenicity of UVA may also be derived from the
therapeutic application of UVA together with psoralens (PUVA). In addition, recent
epidemiological studies have associated the use of sunbeds with the development of malignant
melanoma.
In conclusion, the carcinogenicity of UVA in humans cannot be ruled out, but requires
further validation. Long and repeated UVA exposure should be discouraged, because of the
far-reaching risks involved.
FEL
•
Skin neoplasms
Kommentaren säger att också de histologiska typerna av "Skin Neoplasms" skall uppges.
RÄTT
•
Skin Neoplasms
•
Carcinoma, Squamous Cell
•
Melanoma
34
2.4.5 MISSFÖRSTÅND I SAMBAND MED ORDENS SEMANTIK
Läs nedanstående titel och abstract eller titta på hela referensen i PubMed. Titta också igenom
kommentarerna nedan.
•
Länk till hela referensen
TI –
Exercise-induced changes in oxygen saturation in the "calf muscles" of elderly subjects with
peripheral vascular disease.
AB –
This study noninvasively measured hemoglobin oxygen saturation in young (n = 6, 28 +/- 6
yrs), old healthy (n = 20, 68 +/- 7 yrs), and old subjects with mild peripheral vascular disease
(PVD) (n = 8, 72 +/- 4 yrs). Hemoglobin oxygen saturation was measured as the difference in
absorption at 760 and 850 nm light using near-infrared spectroscopy (NIRS). The lateral
soleus muscle was studied after mild plantar flexion exercise. The time constant of recovery of
oxygen saturation (HBO2Tc) was 21.5 +/- 8.6 s in young, 26.9 +/- 13.5 s in old healthy
subjects. PVD subjects had HbO2Tc values of 104.4 +/- 41.1 s in their "bad" leg and 57.6 +/42.2 s in their "good" leg. The correlation between HbO2Tc and ankle-arm pressures was
significant (r2 = .63, p <.001). six younger normal, five older normal, and seven pvd subjects
also performed a progressive walking test. normal subjects completed the test without
difficulty, and older normal subjects showed progressive deoxygenation. pvd subjects
complained of calf pain (4 out of 5 were able to finish) and showed near-maximal
deoxygenation throughout the test. in summary, nirs measurements show promise as a
method of evaluating the kinetics of oxygen saturation, particularly in patients with mild
peripheral vascular disease.< /p>
FEL
•
Cattle
•
Muscles
Det engelska ordet calf har två olika betydelser, en anatomisk och en zoologisk. I vårt.ex.empel
är det den anatomiska betydelsen man syftar på. Exemplet är enkelt i detta fall, men i andra
fall kan det vara svårare att avgöra vad som är vad. Därför är det viktigt att läsa
kommentarerna till de termer man väljer så man är på det klara med betydelsen innan man
väljer term.
35
RÄTT
•
Leg
•
Muscles
2.5 INDEXERINGSÖVNING
1. Läs titeln och beskriv dess innehåll med lämpliga termer från MeSH.
2. Läs författarens egen formulering av syften och beskriv även dessa med termer och
check tags från MeSH.
3. Avgör vilka aspektord som beskriver MeSH-termernas aspekter.
4. Avgör vilka termer som skall vara IM respektive NIM.
ÖVNING: MYOCARDIAL INFARCTION IN TYPE 1 DIABETES MELLITUS
Syften:
1. To identify the proportion of diabetics among patients with acute myocardial
infarction, and to determine the impact of type 1 diabetes mellitus on morbidity and
mortality during short- and longterm follow-up.
2. To evaluate the impact of a beta-one-selective adrenergic blocker on mortality and
morbidity in diabetic patients with myocardial infarction.
3. To develop and to evaluate the feasibility and safety of a protocol for insulin-glucose
infusion in diabetic patients with acute myocardial infarction.
4. To evaluate the effects of insulin-glucose infusion followed by multidose subcutaneous
insulin on mortality and morbidity in diabetic patients with myocardial infarction.
SVAR PÅ ÖVNINGEN "MYOCARDIAL INFARCTION IN TYPE 1 DIABETES
MELLITUS"
1. Syften:
To identify the proportion of diabetics among "patients" with "acute myocardial infarction",
and to determine the impact of diabetes mellitus on "morbidity" and "mortality" during shortand longterm "follow-up".
36
MeSH-termer:
* Myocardial Infarction /EP/MO/CO/DT
* Diabetes Mellitus, type 1 /EP/MO/CO/DT
Human
Follow-up Studies
2. Syften:
To evaluate the impact of a beta-one-selective "adrenergic blocker" on mortality and
morbidity in diabetic patients with myocardial infarction.
Adrenergic Beta-Antagonists /TU
3. Syften:
To develop and to evaluate the feasibility and safety of a protocol for "insulin-glucose
infusion" in diabetic patients with acute myocardial infarction.
MeSH-termer:
Insulin /AD
Glucose /AD
Infusions, Intravenous
Clinical protocols
4. Syften:
To "evaluate" the effects of insulin-glucose infusion followed by multidose "subcutaneous"
insulin on mortality and morbidity in diabetic patients with myocardial infarction.
MeSH-termer:
Injections, Subcutaneous
37
3 LÄNKAR OM MESH-INDEXERING
•
MeSH-Sökordsguide (bildspel med ljud)
•
Latinsk-svensk ordlista (Göran Sandberg, Karolinska Institutet)
•
Samling av akronymer och förkortningar
•
Online Multiple Congenital Anomaly / Mental Retardation (MCA/MR) Syndromes©
(Stanley Jablonski, NLM)
•
Enheten för klassifikationer och terminologi (Socialstyrelsen)
•
ATC-register (FASS.se)
•
FASS - Läkemedel i Sverige
•
National Library of Medicine Classification (NLM)
•
MeSH Factsheet (NLM)
•
MEDLINE Indexing Online Training Course
•
Frequently asked questions about indexing (NLM)
•
MeSH-termer - hur speglar de världsläget? (Presentation slides)
38
4 MEDICINSK LATHUND
Här hittar du en översiktlig och kortfattad lathund i medicinsk terminologi.
4.1 ALLMÄNT
fatal
dödlig
letal
dödlig
patogen
sjukdomsframkallande
4.2 ANATOMISK LÄGESBESKRIVNING
anterior
främre
posterior
bakre
superior
övre
inferior
nedre
exterior
yttre
interior
inre
dexter
höger
sinister
vänster
kranialt
skall-
dorsalt
rygg-
ventralt
framside-, buksida
superficialis
ytlig
profundus
djup
proximalt
nära [räknat från bålen]
distalt
längre bort [räknat från bålen]
medialt
nära kroppens mittlinje
lateralt
längre bort från kroppens mittlinje
39
4.3 CYTOLOGI
-cyter
-blaster
-fager
stamcell
celler; t.ex. erytrocyter, leukocyter
omogna blodceller; t.ex. erytroblaster, leukoblaster
"renhållningsceller", "ätceller"; t.ex. erytrofager
ursprungscell till alla formade element i blodet, kallas även modercell
4.4 KEMISKA ÄMNEN
Endogena substanser
kroppsegna substanser; t.ex. insulin, blodproteiner
Exogena substanser
icke-kroppsegna substanser; t.ex. läkemedel, kemiska ämnen
som används i diagnostiken
Teratogener
fosterskadande medel; t.ex. neurosedyn
Karcinogener
cancerframkallande medel; t.ex. nitrosaminer, radon
Insekticider
insektsdödande medel; t.ex. organofosfater, DDD
Antagonister
blockerare, motverkande ämnen; t.ex. histaminantagonister,
även kallade antihistaminer
Agonister
stimulerare, förstärker biologiska eller fysiologiska effekter; t.ex.
kalciumagonister
Inhibitorer
hämmare, hämmar biologiska eller fysiologiska effekter; t.ex.
enzyminhibitorer
-as
enzymer; t.ex. acetylkolinesteras
-ol
alkoholer; t.ex. etanol
4.5 KIRURGISKA METODER
ablatio
operativt avlägsnande av ett organ eller vävnad; t.ex. ablatio mammae
abrasio
skrapning; t.ex. livmoderhalsskrapning
anastomos
operativt anlagd förbindelse mellan två blodkärl eller två tarmavsnitt;
t.ex. arteriovenös anastomos, illoanal anastomos.
debridering
avlägsnande av död vävnad i sår eller vidgning av t.ex. infekterat sår
för att tömma ut var
40
excision
avlägsnande av del av organ eller vävnad; t.ex. tarmexcision
exstirpation
operativt avlägsnande av ett organ eller vävnad; t.ex.
halsmandelsexstirpation
ligation
tillknytning av t.ex. blodkärl
lambå
en flik av hud eller slemhinna avsedd för att täcka vävnadsskador eller
vävnadsdefekter
-ektomi
operativt avlägsnande av hela organ eller organdelar; t.ex.
appendektomi, lobektomi
-stomi
operativt anlagd öppning; t.ex. trakeostomi, kolostomi
-plastik
rekonstruktiv, korrigerande eller kosmetisk kirurgi; t.ex.
mammaplastik
extraktion
utdragning; t.ex. tandextraktion
resektion
avskärande, avlägsnande av en del av ett organ; t.ex. tarmresektion
sektion
operativt snitt (t.ex. kejsarsnitt) eller liköppning vid obduktion
bypass, shunt
kirurgiskt anlagd förbiledning, genväg eller omväg; t.ex. aortabypass,
shuntkoppling
4.6 LÄKEMEDEL
anti-, ant-, an-
medel mot; t.ex. antihypertonimedel, antacida, analgetika
administration av läkemedel
tillförsel av läkemedel
produktnamn
handelsnamn; t.ex. Losec, Viagra
generiskt namn
anger kemisk sammansättning; t.ex. omeprazol,
sildenafilcitrat
4.7 PATOLOGISKA FÖRÄNDRINGAR
-trofi
större celler, tillväxt av celler; t.ex. hypertrofi
-plasi
vävnadsökning, vävnadsförstoring; t.ex. hyperplasi
-nekros
celldöd, vävnadsdöd; t.ex. osteonekros
-skleros
förhårdning eller förtätning i vävnader; t.ex. ateroskleros
41
-ödem
svullnad, vattenansamling; t.ex. lungödem
-cirros
skrumpning; t.ex. levercirros (skrumplever)
-fissure
spricka, fåra; t.ex. slemhinnefissure
-fistel
onormal förbindelse mellan organ; t.ex. analfistel
-hernia
bråck; t.ex. diafragmabråck
-infarkt
vävnadsdöd i ett begränsat område; t.ex. hjärtinfarkt
-ischemi
blodbrist, syrebrist i ett begränsat område; t.ex. hjärtischemi
-lesion
skada eller organförändring pga sjukdom; t.ex. muskellesion
-stas
stockning i blodkärl som resulterara i sjukdom; t.ex. stasdermatit
(eksem pga dålig venfunktion)
-striktur
förträngning i ett organ; t.ex. tarmstriktur
-torsion
vridning; t.ex. testikeltorsion
-purulent
varig
-pus
var
-pyogen
varbildande
-suppuration
varbildning
4.8 SJUKDOMAR
-pati
sjukdom, lidande; t.ex. neuropati, nefropati
-it
inflammatoriska sjukdomar; t.ex. otit, gastrit
-uri
i urinet; t.ex. hematuri, bakteriuri
-emi
i blodet; t.ex. glykemi, uremi
hypo-
låg, nedsatt; t.ex. hypotoni, hypoglykemi
hyper-
hög, ökad; t.ex. hypertoni, hyperglykemi
4.8.1 TUMÖRER, SVULSTER, NEOPLASMER, CANCER
benign
godartad
malignt
elakartad
42
-om
godartade eller elakartade svulster, tumörer; t.ex. lipom, sarkom,
melanom
magcancer
lokalisering av cancer i magen
leukemi
blodcancer
4.8.2 SYNDROM – FLERA SAMMANHÄNGANDE
SJUKDOMSTECKEN
Eponyma benämningar
t.ex. Downs syndrom, Creutzfeldt-Jakob syndrom
Beskrivande benämningar
t.ex. kronisk trötthetssyndrom, cri-du-chat-syndrom
4.8.3 TRAUMA, SKADOR, OLYCKSFALL
fraktur
skelettbrott; t.ex. höftfraktur
ruptur
bristning; t.ex. meniskruptur, bäckenbottenruptur
dislokation
luxation
perforation
felläge; t.ex. axelledsdislokation
urledvridning; t.ex. ledluxation
genomträngning, genomborrning; t.ex. tarmperforation
distorsion
stukning, vrickning, förvrängning; t.ex. leddistorsion
kontusion
stöt- eller krosskada, blåmärke
laceration
sönderslitning av vävnader, ojämna sårkanter
4.9 UNDERSÖKNINGAR
-skopi
besiktning eller inspektion av ett inre organ med hjälp av ett "-skop"; t.ex.
gastroskopi och gastroskop
-grafi
undersökning som resulterar i grafiska element som bilder, kurvor eller
diagram; t.ex. radiografi, EKG
-metri
mätning, uppmätning av organ eller funktion; t.ex. pelvimetri, audiometri
biopsi
vävnadsprov
43
autopsi
obduktion
palpation
undersökning av organ med händerna
44
5. TERMER FÖR ”UPPLEVELSER” OCH
”BEMÖTANDE”
Letar du efter artiklar som handlar om känslor, upplevelser, attityder eller bemötande av
patienter? Tycker du att det är svårt att hitta bra sökord? Nu finns en lista över termer för
“Upplevelser” och “Bemötande” i olika former, som du kan använda vid sökning i PubMed,
SveMed+ och Cinahl.
•
Ladda ner listan över termer för "upplevelser" och "bemötande" (PDF)
45
6. KONTAKTA OSS
Kontakta oss gärna med frågor om MeSH eller om du har förslag till förbättringar av
handledningen.
Gun Brit Knutssøn
Tel: 08-524 84 183
E-post: gunbrit.knutssoen@ki.se
Klas Moberg
Tel: 08-524 84 063
E-post: klas.moberg@ki.se
46